Služba za računovodstvo i finansije obavlja poslove koji se odnose na: obavljanje finansijskih, računovodstveno - knjigovodstvenih poslova vezanih za realizaciju poslova iz djelokruga rada Zavoda; računovodstveno vođenje utroška budžetskih sredstava, namjenskih sredstava uređenja građevinskog zemljišta, sredstava uplaćenih od strane kantonalnih ministarstava i Općina za projekte od važnosti za Kanton Sarajevo, naknade za pogodnost i posebne naknade iz osnova legalizacije bespravno izgrađenih objekata; pripremanje Budžeta i računovodstveno vođenje utroška budžetskih sredstava, sredstava uređenja građevinskog zemljišta, naknade za pogodnost i posebne naknade iz osnova legalizacije bespravno izgrađenih objekata; praćenje priliva i odliva sredstava po utvrđenoj namjeni; iskazuje potrebe i učestvuje u procesu javne nabavke iz nadležnosti službe i druge poslove iz djelokruga rada Zavoda po nalozima pomoćnika direktora Sektora za računovodstvo, finansije i zajedničke poslove i direktora Zavoda.